Tenacibaculum dicentrarchi surgió como un patógeno importante en la salmonicultura chilena a principios de 2023, causando el 32.9% de las mortalidades del salmón del Atlántico (Salmo salar). Aunque estudios recientes han proporcionado información valiosa sobre T. dicentrarchi a través de mecanismos de virulencia y análisis del genoma, la diversidad genética basada en el clúster de genes del antígeno “O” sigue siendo en gran medida inexplorada.
Por esta razón, el Dr. Ruben Avendaño-Herrera y el Dr. Pierre Lopez, ambos investigadores de la Universidad Andrés Bello y Centro INCAR, desarrollaron un nuevo estudio que revela la existencia de distintos genotipos de antígenos dentro de aislados chilenos de Tenacibaculum dicentrarchi, y a la vez, proponen un PCR multiplex para la tipificación rápida.
“Hasta ahora, se conocía la existencia de diversidad antigénica dentro de la especie de T. dicentrarchi. Sin embargo, no se había demostrado con un estudio específico. Con esta investigación, nosotros analizamos en el genoma de aislados de T. dicentrarchi y demostramos la existencia de un conjunto de genes asociados al antígeno «O». Demostrando que existen al menos 4 tipos de T. dicentrarchi”, destacó el Dr. Ruben Avendaño.
El investigador enfatizó la importancia de este estudio inédito, resaltando que de esta forma ya se conoce que diferentes tipos de T. dicentrarchi causan las mortalidades de los salmones que se cultivan en Chile. “Por tanto, con esta información, las empresas farmacéuticas podrán seleccionar los aislados más representativos para el diseño y desarrollo de futuras vacunas contra la tenacibaculosis”, resaltó.
En cuanto al diseño de un PCR múltiplex, explicó que “permite a los colegas investigadores tipificar sus aislados en todo el mundo y realizar estudios epidemiológicos sobre la realidad de la tenacibaculosis en sus respectivos países. De hecho, estamos muy contentos porque al día de hoy nos han solicitado el artículo colegas de USA, Canadá y Nueva Zelanda, denotando lo importante que es el estudio y las expectativas que tienen de emplear el PCR múltiplex”.
El Dr. Avendaño señaló que actualmente están realizan el Proyecto FONDECYT 1230068 sobre coinfecciones de distintos Tenacibaculum spp., “por lo que la herramienta que desarrollamos nos ha permitido detectar diversidad en las bacterias aisladas que provocan los brotes de campo. Actualmente, estamos desarrollando los estudios para precisamente validar los postulados de Koch y ver si hay diferencia entre los aislados de T. dicentrarchi”, aseveró.
Un zoom a la investigación
En el estudio se realizó un análisis genómico comparativo de los genes de biosíntesis del antígeno “O” en 30 cepas secuenciadas de genoma completo, incluida la cepa tipo de T. dicentrarchi.
El análisis identificó un único clúster de genes del antígeno “O” (O-AGC) que consta de 20 genes involucrados en la biosíntesis de este componente de la capa de lipopolisacáridos.
Tras ello, las variaciones en el O-AGC revelaron diversidad antigénica dentro de la especie, lo que permitió la clasificación en cuatro grupos distintos, designados Tipos 1 a 4.
Basándose en estos hallazgos, los investigadores desarrollaron un esquema de genotipado basado en PCR multiplex, que se aplicó con éxito a 25 aislados bacterianos de pisciculturas chilenas. La mayoría de los aislados se identificaron como Tipos 1 y 3, mientras que los Tipos 2 y 4 fueron menos comunes, con el mismo número de aislados.
Los expertos también investigaron si la filogenia del genoma central se correlacionaba con los Tipos de O-AGC al incluir genomas disponibles públicamente de Chile, Noruega y Canadá.
Los aislados de T. dicentrarchi se agruparon en dos grupos: uno que comprende aislados de Noruega y Canadá, todos pertenecientes al Tipo 1. Otro grupo consistió en aislados chilenos con diversos Tipos de O-AGC (es decir, 1, 2, 3 y 4), incluida la cepa tipo.
