Chile es uno de los mayores productores de trucha arcoíris en el mundo. Sin embargo, la aparición y propagación de enfermedades causadas por agentes patógenos como bacterias, hongos, parásitos y virus, pueden causar pérdidas significativas a la industria acuícola.
Entre las infecciones provocadas por patógenos virales, se encuentra la necrosis pancreática infecciosa (IPN), la cual se ha convertido en la principal causa de mortalidad por enfermedad en esta especie, con una incidencia promedio del 19,9% en agua de mar y del 20,18% en agua dulce, según el informe sanitario de Sernapesca, correspondiente al período 2021-2023.
Si bien se han implementado diversas estrategias para prevenir y combatir el IPNV, entre ellas vacunas y antivirales, los resultados no han alcanzado la eficacia esperada, por lo que se hace necesario avanzar en nuevas soluciones.
En este contexto, la Universidad de Santiago de Chile posee una sólida trayectoria en investigación básica y aplicada para abordar enfermedades en peces. Como parte de esta línea de trabajo, actualmente ejecuta el proyecto de I+D “Análisis del rol de RNA no codificantes largos (lncRNA) en la interacción entre calentamiento global y la respuesta al Virus de la Necrosis Pancreática Infecciosa (IPNV) en el cultivo de trucha arcoíris”.
La iniciativa es liderada por la Dra.(c) Francisca Madrid Silva y el Dr. Rodrigo Vidal Soto, investigador y director del Laboratorio de Genómica de la Facultad de Química y Biología. El proyecto cuenta con financiamiento de ANID, la colaboración de Caleta Bay, empresa asociada, y el apoyo de la Dirección de Gestión Tecnológica de la Vriic.
“Nuestro objetivo es entender cómo el incremento de la temperatura en los mares, asociado al cambio climático, influye en la respuesta de la regulación del RNA no codificante de la trucha arcoíris frente al IPNV, el cual daña gravemente la salud de los peces, especialmente en sus etapas de alevines y juveniles. Además, genera altas tasas de mortalidad”, señala Francisca Madrid.
Investigación genómica
Para abordar este desafío, el equipo centrará su trabajo en el estudio de genes poco explorados, conocidos como RNA no codificantes largos (lncRNA). “Corresponden a la materia oscura del genoma de organismos vertebrados y cumplen un rol clave en la activación y/o desactivación de genes y proteínas”, explica el Dr. Vidal.
Asimismo, agrega que se desarrollarán ensayos experimentales a distintas temperaturas para analizar el material genético de las especies y evaluar cómo cambia su respuesta frente al virus.
El proyecto contempla dos años de ejecución. Durante la primera etapa, a nivel de laboratorio, se estudiará a peces infectados en etapa de alevines sometidos a diferentes temperaturas.
“Luego de esta fase, vamos a extraer el RNA, el cual se secuenciará para obtener librerías genómicas y realizar los análisis correspondientes. Posteriormente, se hará la validación experimental de estos análisis con la empresa asociada”, comenta la investigadora.
Vinculación con la industria
Caleta Bay es una de las principales productoras de trucha arcoíris en Chile y destaca por impulsar una cultura de investigación y desarrollo permanentes, además de un manejo sostenible en los cultivos. En ese sentido, el académico señala que la empresa presenta “el menor índice de uso de antibióticos y la menor baja de mortalidad”.
Ambos investigadores coinciden en que este trabajo conjunto entre la academia y el sector privado constituye una oportunidad concreta para generar conocimiento con impacto real.
“Esto tiene muchos impactos positivos, porque permite que una investigación de laboratorio pueda transformarse en una solución real a un problema en específico dentro del área de la ciencia biológica”, indica Francisca Madrid.
Por su parte, el Dr. Rodrigo Vidal explica que uno de los principales resultados esperados es “generar información genómica sobre la resiliencia de la trucha arcoíris, que permita a la empresa asociada fortalecer el manejo genético y las estrategias productivas frente al cambio climático”.
Asimismo, destaca que la iniciativa no solo fortalecerá la vinculación entre universidad e industria, sino que también aportará innovación a la acuicultura nacional, donde uno de los grandes desafíos ya no es producir más, sino producir mejor.
“Y ese mejor tiene que ser dentro de un ciclo optimizado, es decir, poder completar los ciclos de producción, pero a bajo costo”, puntualiza el académico.
