La enfermedad branquial amebiana (AGD) y la enfermedad branquial compleja (CGD) son trastornos recurrentes de las branquias en el salmón del Atlántico, lo que resulta en pérdidas significativas para la acuicultura.
El papel de los microbiomas branquiales en el desarrollo de la enfermedad branquial no está claro. Se realizó un estudio longitudinal para caracterizar el tejido branquial y los microbiomas del moco branquial del salmón del Atlántico de cultivo antes y durante un episodio de enfermedad branquial.
Metodología utilizada
Usando un protocolo de extracción de ADN recientemente optimizado, secuenciamos genes de ARNr de microbiomas de muestras de branquias tomadas de 105 salmones individuales en una granja, durante una temporada de verano. El agente etiológico de AGD, Neoparamoeba perurans, se cuantificó por PCR dirigido a los genes 18S rRNA.
Se llevaron a cabo análisis similares en muestras de moco. Los raspados de moco fueron sustitutos adecuados y no letales para la caracterización de la comunidad procariótica branquial en este estudio. Los microbiomas del tejido branquial y la mucosidad branquial cambiaron durante la campaña, lo que se correlaciona con las concentraciones de N. perurans.
Algunos resultados
El tiempo explicó el 35 % de la variación del microbioma del tejido branquial y el moco branquial, mientras que las concentraciones de N. perurans explicaron el 5 %. Los géneros que incluyen Dyadobacter, Shewanella y Pedobacter fueron abundantes al máximo en las muestras de mucosidad y branquias en el punto de tiempo anterior a la detección de signos de trastornos branquiales, en T3.
Shewanella fue significativamente más abundante antes que durante el episodio de la enfermedad de las branquias, y sugerimos que este género podría considerarse en estudios futuros que aborden las relaciones entre la enfermedad de las branquias y el microbioma de las branquias.
Puede revisar el estudio completo aquí
