En Puerto Varas se está desarrollando el “First International Meeting on Genome Editing in Aquaculture”, organizado por EDIGEN y la Universidad de Chile, que reúne a académicos, centros de investigación, casas genéticas y representantes de la industria acuícola para revisar el estado del arte de la edición génica en especies de cultivo.
En la apertura de la primera jornada, la Dra. Alison Van Eenennaam (University of California, Davis) presentó el panorama global de la edición génica en animales de producción, destacando que la acuicultura se ha convertido en uno de los sectores con mayor actividad en investigación, con trabajos en crecimiento, eficiencia alimenticia, tolerancia a estrés, resistencia a enfermedades y esterilidad. La investigadora subrayó que la edición se plantea como una herramienta que complementa el mejoramiento genético tradicional.
Como marco conceptual, también se incluyeron las presentaciones del Dr. Miguel Allende y la Dra. Fernanda Almeida en especies modelo y nativas no salmonídeas, que ilustraron la amplitud de aplicaciones de estas tecnologías más allá de los salmónidos.
SRS: metabolismo del hierro y variación genética en coho
La enfermedad SRS, causada por Piscirickettsia salmonis, fue uno de los ejes centrales del programa del día donde el Dr. Sebastián Escobar (Pontificia Universidad Católica de Chile) presentó resultados de un proyecto centrado en el rol del hierro y de la transferrina en la interacción entre salmón Atlántico y P. salmonis. Mediante edición génica con CRISPR, desarrollada en salmón Atlántico en un centro de investigación en Noruega debido a las restricciones regulatorias en Chile, su equipo generó peces mutantes para el gen de transferrina y analizó su impacto sobre la homeostasis de metales traza y la respuesta frente al patógeno. Los resultados muestran cambios no solo en hierro, sino también en otros metales como vanadio y manganeso, aportando antecedentes sobre la función de la transferrina en el contexto de SRS.
Por su parte, Constanza Urzúa-Encina (LABGEN, Universidad de Chile) expuso un meta-análisis de estudios de GWAS en salmón coho, especie que en desafíos experimentales presenta menor mortalidad frente a SRS en comparación con el Atlántico. A partir de cinco desafíos y miles de peces evaluados, se identificó una región en el grupo de ligamiento 21 con numerosos SNP significativamente asociados a supervivencia, lo que contribuye a caracterizar la base genética de la resistencia en coho y a generar potenciales blancos para selección y futuros estudios de edición génica.
BKD y robustez inmune en programas comerciales
La presentación de Ángela Astudillo, de Benchmark Genetics Chile, se enfocó en la enfermedad bacteriana del riñón (BKD) en salmón Atlántico, utilizando información de un programa comercial de mejoramiento genético.
A partir de datos de varias generaciones genotipadas con un chip de alta densidad, se realizaron GWAS que identificaron regiones significativas en el cromosoma 35 asociadas a resistencia a BKD, donde se ubican genes vinculados a respuesta inmune. En su exposición, Astudillo introdujo el concepto de “robustez genética”, entendido como la contribución de ciertos genes y vías a la respuesta frente a distintos patógenos, lo que abre la posibilidad de diseñar estrategias de mejoramiento que apunten a componentes inmunes de efecto más amplio.
IPN en salmón y trucha: del QTL consolidado a nuevas variantes
La investigadora Tamara Montenegro-Candia (LABGEN, Universidad de Chile) revisó el conocido QTL de resistencia a IPN en el cromosoma 26 de salmón Atlántico, ampliamente utilizado en selección asistida por marcadores, y presentó resultados recientes de secuenciación de pools de peces resistentes y susceptibles. El análisis ha permitido acotar un conjunto de variantes fuertemente asociadas a la resistencia, en su mayoría en regiones regulatorias cercanas a genes candidatos, sin evidencia de grandes variantes estructurales en la zona, lo que sugiere un mecanismo principalmente regulatorio.
En tanto, Connie Eliza Claure Guisbert (Universidad de Los Lagos) presentó un estudio de variantes estructurales asociadas a IPN en trucha arcoíris, basado en la comparación del genoma de peces resistentes y susceptibles mediante distintos algoritmos de detección. El trabajo se orienta a identificar inserciones, deleciones, duplicaciones e inversiones que se superpongan con genes inmunes o con potencial impacto funcional, con el objetivo de incorporar este tipo de variantes a futuros análisis de resistencia y eventuales aplicaciones en mejoramiento o edición génica.
Edición en salmón y escalamiento industrial
El Dr. Ross Houston (Benchmark Genetics, Reino Unido) abordó el tema “Gene Editing in Salmon Aquaculture: Targets and Applications”, analizando cómo la edición génica puede integrarse a los programas de cría existentes. En su presentación, destacó que la selección genética continuará siendo la base de la acuicultura, pero que la edición ofrece la posibilidad de introducir nueva variación para rasgos de interés, acelerar el progreso en ciertas características y abordar objetivos complejos como la resistencia a piojo de mar, utilizando información proveniente de estudios genómicos y de especies más resistentes, como el coho.
En el bloque de industria, el Dr. Derek Bickhart (Hendrix Genetics) —citado en el programa en el contexto de “High-throughput screening of gene-edited animals”— puso el foco en la necesidad de contar con plataformas de screening de alto rendimiento para verificar las ediciones realizadas, evaluar la presencia de mosaicos y potenciales off-targets, y asegurar la calidad genética de los animales editados de cara a reguladores y mercados.
Finalmente, el Dr. Matthew Josephson (Center for Aquaculture Technologies, CAT) presentó la experiencia de la empresa en lo que denominan “next-gen breeding”, integrando mejoramiento genético, genómica, edición y genotipado. Mostró casos de aplicación en especies como la tilapia, en contextos regulatorios que ya contemplan la evaluación de animales editados, y describió la operación de laboratorios móviles capaces de inyectar grandes volúmenes de embriones en pocos días, con el objetivo de trabajar en escalas compatibles con la producción comercial.
Regulación y perspectiva para Chile
En esta primera jornada, el director de EDIGEN, Dr. José Manuel Yáñez (Universidad de Chile), se refirió a los aspectos regulatorios de la edición génica en el contexto nacional e internacional. En conversación, distinguió entre las primeras generaciones de organismos transgénicos y las ediciones específicas sin inserción de ADN exógeno, señalando que hoy existen marcos diferenciados en varios países.
“Estas tecnologías van a cambiar las reglas del juego de cómo se produce proteína de origen animal; en acuicultura ya hay ejemplos muy claros”, indicó. Yáñez explicó que en distintos mercados algunas ediciones puntuales no se regulan de la misma forma que los transgénicos clásicos, lo que ha permitido avanzar en investigación aplicada y en la evaluación de animales editados.
“En Chile no necesariamente tenemos que modificar la ley; es un asunto de interpretación. Definir con claridad qué es GMO y qué no lo es en el caso de la edición génica podría darnos un salto regulatorio para fomentar la investigación”, planteó. Según agregó, existe un interés creciente de empresas productoras y casas genéticas en explorar estas herramientas para enfrentar desafíos sanitarios de alta relevancia para la salmonicultura nacional.
“Hay mucho interés de productores y de las compañías de genética, porque ven soluciones muy cercanas en temas de salud, especialmente en resistencia a SRS y a Caligus”, sostuvo. El encuentro EDIGEN continuará este jueves con nuevas presentaciones científicas y espacios de discusión en torno a la edición génica en acuicultura.
