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IFOP advierte cambio epidemiológico del SRS y mayor resistencia al florfenicol

El programa permanente de vigilancia del Instituto de Fomento Pesquero (IFOP) confirmó la consolidación del genogrupo LF-89 en centros de engorda, asociado a un 60% de muestras "no silvestres" a florfenicol. En agua dulce, la oxitetraciclina concentra el 76,6% de pérdida de susceptibilidad.

Por David Naguil
30 de julio, 2026 - 19:00 hrs.
El 60% de los aislados de SRS en mar presentó pérdida de susceptibilidad al florfenicol. Foto: IFOP.

El 60% de los aislados de SRS en mar presentó pérdida de susceptibilidad al florfenicol. Foto: IFOP.

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En el marco del taller de difusión de resultados de los programas permanentes del Instituto de Fomento Pesquero (IFOP) y la Subsecretaría de Pesca y Acuicultura (Subpesca), se presentaron los datos epidemiológicos de la etapa 2025-2026 sobre la resistencia a los dos principales fármacos de uso habitual en la industria: florfenicol y oxitetraciclina. Durante la exposición liderada por el IFOP, el Dr. Cristian Valenzuela, investigador del Departamento de Salud Hidrobiológica de IFOP, reveló tendencias en el comportamiento de Piscirickettsia salmonis en agua de mar, así como un patrón contrapuesto en los patógenos que afectan la fase de agua dulce. LF-89 y categoría «no silvestre» Durante el período evaluado, el IFOP realizó 34 muestreos en 32 centros de cultivo distribuidos en 19 Áreas de Concesión de Salmonicultura (ACS) de las regiones de Los Lagos y Aysén. De las cepas de P. salmonis aisladas y analizadas mediante la determinación de la Concentración Mínima Inhibitoria (CMI), un 60% fue clasificado como «no silvestre» para florfenicol. El término «no silvestre» no implica que la bacteria haya sido modificada en un laboratorio, sino que ha adquirido mecanismos genéticos o estructurales de resistencia (como bombas de eflujo o alteraciones metabólicas) que la desplazan por encima del Valor de Corte Epidemiológico (ECOFF). Al superar este umbral natural, la población bacteriana reduce su susceptibilidad y aumenta el riesgo de fallas terapéuticas en el centro de cultivo. Un hallazgo crítico expuesto por el IFOP es la erradicación práctica del genogrupo EM-90 en las muestras de terreno. Mientras que históricamente la distribución entre genogrupos era pareja, en el ciclo 2025 el 100% de los aislados correspondió al genogrupo LF-89. Esta sustitución genética tiene consecuencias directas en la eficacia de los tratamientos en mar, ya que las cepas LF-89 presentan una resistencia sustancialmente mayor al florfenicol (72,3% clasificadas como no silvestres) en comparación con el genogrupo EM-90 (46,7%). En este marco, Cristian Valenzuela explicó que, «el término silvestre hace referencia a una cepa que no ha sufrido modificaciones en su susceptibilidad original. Las que se posicionan a la derecha del valor de corte epidemiológico son aquellas que han adquirido algún mecanismo de resistencia. A partir de los años 2020 y 2021 comenzó a incrementarse la proporción de cepas del genotipo LF-89, hasta que en 2025 solamente se aislaron cepas de este genogrupo». El Dr. Cristian Valenzuela, investigador del Departamento de Salud Hidrobiológica de IFOP. Foto: IFOP Agua dulce En pisciculturas y alevinajes, las 142 cepas analizadas de Flavobacterium psychrophilum mostraron un escenario totalmente opuesto. Mientras el florfenicol mantiene una altísima eficacia frente a este patógeno con apenas un 3% de cepas no silvestres, la oxitetraciclina concentró un preocupante 76,6% de pérdida de susceptibilidad, reflejando que este principio activo representa cerca del 60% de los tratamientos administrados en agua dulce. Por su parte, el análisis en Renibacterium salmoninarum (BKD) arrojó un 30,6% de cepas no silvestres para florfenicol y un 18,9% para oxitetraciclina sobre 122 aislados evaluados. Microbiota intestinal y proyecciones 2026-2027 El estudio de IFOP también evaluó 281 cepas de la microbiota intestinal de salmónidos (con predominio de géneros como Shewanella, Aliivibrio y Clostridium). Los recuentos mostraron que un 76% de estas bacterias comensales presentan pérdida de susceptibilidad a florfenicol y un 60% a oxitetraciclina, confirmando que el tracto digestivo de los peces actúa como un importante reservorio genético de resistencia antimicrobiana en el medio acuático. Como parte de las proyecciones para la etapa 2026-2027, el IFOP anunció la puesta a punto de técnicas de aislamiento para incorporar formalmente la vigilancia sobre patógenos del género Tenacibaculum spp., respondiendo al alza de mortalidades por tenacibaculosis en la industria. Asimismo, el equipo investigador se encuentra trabajando junto al Dr. Rubén Avendaño en la actualización y publicación de los nuevos valores de corte epidemiológico estandarizados para Piscirickettsia salmonis.

En el marco del taller de difusión de resultados de los programas permanentes del Instituto de Fomento Pesquero (IFOP) y la Subsecretaría de Pesca y Acuicultura (Subpesca), se presentaron los datos epidemiológicos de la etapa 2025-2026 sobre la resistencia a los dos principales fármacos de uso habitual en la industria: florfenicol y oxitetraciclina.

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Durante la exposición liderada por el IFOP, el Dr. Cristian Valenzuela, investigador del Departamento de Salud Hidrobiológica de IFOP, reveló tendencias en el comportamiento de Piscirickettsia salmonis en agua de mar, así como un patrón contrapuesto en los patógenos que afectan la fase de agua dulce.

LF-89 y categoría «no silvestre»

Durante el período evaluado, el IFOP realizó 34 muestreos en 32 centros de cultivo distribuidos en 19 Áreas de Concesión de Salmonicultura (ACS) de las regiones de Los Lagos y Aysén. De las cepas de P. salmonis aisladas y analizadas mediante la determinación de la Concentración Mínima Inhibitoria (CMI), un 60% fue clasificado como «no silvestre» para florfenicol.

El término «no silvestre» no implica que la bacteria haya sido modificada en un laboratorio, sino que ha adquirido mecanismos genéticos o estructurales de resistencia (como bombas de eflujo o alteraciones metabólicas) que la desplazan por encima del Valor de Corte Epidemiológico (ECOFF). Al superar este umbral natural, la población bacteriana reduce su susceptibilidad y aumenta el riesgo de fallas terapéuticas en el centro de cultivo.

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Un hallazgo crítico expuesto por el IFOP es la erradicación práctica del genogrupo EM-90 en las muestras de terreno. Mientras que históricamente la distribución entre genogrupos era pareja, en el ciclo 2025 el 100% de los aislados correspondió al genogrupo LF-89.

Esta sustitución genética tiene consecuencias directas en la eficacia de los tratamientos en mar, ya que las cepas LF-89 presentan una resistencia sustancialmente mayor al florfenicol (72,3% clasificadas como no silvestres) en comparación con el genogrupo EM-90 (46,7%).

En este marco, Cristian Valenzuela explicó que, «el término silvestre hace referencia a una cepa que no ha sufrido modificaciones en su susceptibilidad original. Las que se posicionan a la derecha del valor de corte epidemiológico son aquellas que han adquirido algún mecanismo de resistencia. A partir de los años 2020 y 2021 comenzó a incrementarse la proporción de cepas del genotipo LF-89, hasta que en 2025 solamente se aislaron cepas de este genogrupo».

Dr. Cristian Valenzuela durante la presentación de resultados del programa de vigilancia de resistencia bacteriana.
El Dr. Cristian Valenzuela, investigador del Departamento de Salud Hidrobiológica de IFOP. Foto: IFOP

Agua dulce

En pisciculturas y alevinajes, las 142 cepas analizadas de Flavobacterium psychrophilum mostraron un escenario totalmente opuesto. Mientras el florfenicol mantiene una altísima eficacia frente a este patógeno con apenas un 3% de cepas no silvestres, la oxitetraciclina concentró un preocupante 76,6% de pérdida de susceptibilidad, reflejando que este principio activo representa cerca del 60% de los tratamientos administrados en agua dulce.

Por su parte, el análisis en Renibacterium salmoninarum (BKD) arrojó un 30,6% de cepas no silvestres para florfenicol y un 18,9% para oxitetraciclina sobre 122 aislados evaluados.

Microbiota intestinal y proyecciones 2026-2027

El estudio de IFOP también evaluó 281 cepas de la microbiota intestinal de salmónidos (con predominio de géneros como Shewanella, Aliivibrio y Clostridium). Los recuentos mostraron que un 76% de estas bacterias comensales presentan pérdida de susceptibilidad a florfenicol y un 60% a oxitetraciclina, confirmando que el tracto digestivo de los peces actúa como un importante reservorio genético de resistencia antimicrobiana en el medio acuático.

Como parte de las proyecciones para la etapa 2026-2027, el IFOP anunció la puesta a punto de técnicas de aislamiento para incorporar formalmente la vigilancia sobre patógenos del género Tenacibaculum spp., respondiendo al alza de mortalidades por tenacibaculosis en la industria. Asimismo, el equipo investigador se encuentra trabajando junto al Dr. Rubén Avendaño en la actualización y publicación de los nuevos valores de corte epidemiológico estandarizados para Piscirickettsia salmonis.

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