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El microbioma revela una diferencia mayor de la esperada entre el salmón silvestre y el de cultivo

Una nueva investigación sobre el microbioma intestinal del salmón del Atlántico (Salmo salar) revela diferencias más profundas de lo esperado entre ejemplares silvestres y de cultivo.

Por Jocelyn Vargas
23 de agosto, 2026 - 21:39 hrs.
Los salmones de cultivo reciben alimento estandarizado, mientras que los salmones silvestres consumen una dieta variada en su entorno natural. Foto: Gorm Kallestad / NTB.

Los salmones de cultivo reciben alimento estandarizado, mientras que los salmones silvestres consumen una dieta variada en su entorno natural. Foto: Gorm Kallestad / NTB.

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El intestino del salmón alberga miles de especies de microorganismos que interactúan con el organismo y entre sí. Aunque durante años la atención de la investigación acuícola se ha concentrado principalmente en factores como la genética, la alimentación, las enfermedades y las condiciones ambientales, el microbioma intestinal está adquiriendo una importancia creciente como componente de la salud y la resiliencia de los peces. Un equipo de investigadores analizó 847 muestras de contenido intestinal de salmones provenientes de Noruega, Escocia e Irlanda. La investigación incluyó ejemplares silvestres y de cultivo, procedentes tanto de agua dulce como marina. Además del contenido intestinal, los científicos examinaron muestras de alimento y del agua en la que vivían los peces, con el objetivo de determinar qué factores explicaban las diferencias observadas en sus comunidades microbianas. Una brecha microbiana más amplia de lo esperado Uno de los principales hallazgos fue la marcada diferencia entre el microbioma intestinal de los salmones silvestres y el de los ejemplares de cultivo. Los salmones de cultivo presentaron una menor diversidad bacteriana y una composición microbiana diferente. De acuerdo con los investigadores, las comunidades bacterianas presentes en estos peces también parecen estar más especializadas y adaptadas a las condiciones propias de los sistemas de cultivo. Esta diferenciación resulta relevante porque una mayor diversidad microbiana puede proporcionar al organismo una mayor capacidad de respuesta frente a cambios y perturbaciones. En términos ecológicos, una comunidad compuesta por numerosos microorganismos diferentes podría ofrecer una mayor estabilidad funcional ante enfermedades, estrés o modificaciones ambientales. Sin embargo, los investigadores advierten que todavía no es posible establecer una relación causal directa entre una menor diversidad bacteriana y una mayor incidencia de enfermedades. El estudio identifica una asociación y plantea una hipótesis que deberá ser investigada mediante nuevos experimentos. El microbioma cambia a medida que el salmón crece La investigación también muestra que la comunidad bacteriana intestinal no permanece estática durante el desarrollo del pez. A medida que el salmón crece, determinadas bacterias disminuyen o desaparecen, mientras otras aumentan su abundancia y pasan a dominar la comunidad microbiana. Este fenómeno es consistente con un proceso conocido como sucesión ecológica, mediante el cual las comunidades de microorganismos se modifican progresivamente en respuesta a factores relacionados con el hospedador, la alimentación y el ambiente. Entre los microorganismos identificados destaca el género Mycoplasma, que aparece en cantidades particularmente elevadas en el intestino del salmón. Los investigadores consideran que este grupo bacteriano ha evolucionado en estrecha asociación con el salmón durante miles de años y se ha convertido en uno de los componentes dominantes de su microbiota intestinal. La presencia predominante de Mycoplasma, sin embargo, no permite por sí sola determinar si su efecto es beneficioso, perjudicial o simplemente consecuencia de las condiciones fisiológicas del pez. Precisamente, conocer la función de estas bacterias constituye uno de los desafíos centrales para la investigación futura. La dieta emerge como uno de los factores determinantes Entre todos los factores analizados, la alimentación aparece como uno de los elementos con mayor capacidad para explicar las diferencias en la microbiota intestinal. El estudio determinó que aproximadamente el 23 % de la variación en la composición bacteriana del salmón de cultivo puede explicarse únicamente por la dieta. La diferencia resulta especialmente significativa al comparar los sistemas productivos con el ambiente natural. Mientras los salmones de cultivo reciben dietas formuladas y estandarizadas, los ejemplares silvestres consumen una variedad de organismos que cambia según su entorno, etapa de desarrollo y disponibilidad de alimento. Esta diferencia nutricional puede contribuir a explicar por qué ambos grupos desarrollan comunidades bacterianas tan distintas. El hallazgo también plantea una cuestión estratégica para la acuicultura: si determinadas características de la dieta favorecen comunidades microbianas asociadas con una mejor condición fisiológica, la formulación del alimento podría convertirse en una herramienta adicional para promover la salud de los peces. No obstante, aún es necesario determinar qué componentes específicos de la dieta producen estos efectos y, sobre todo, si los cambios en el microbioma se traducen efectivamente en una mayor resistencia frente a enfermedades o estrés. Más allá de la jaula: el ambiente también importa La alimentación no es el único factor involucrado. Los investigadores encontraron que el ambiente en el que viven los peces también influye en la composición de sus comunidades bacterianas. Este efecto varía entre regiones y a través de las distintas etapas del ciclo de vida del salmón. La interacción entre hospedador, alimentación y ambiente genera comunidades microbianas que pueden cambiar considerablemente a lo largo del desarrollo del pez. Para la industria acuícola, esta perspectiva resulta relevante porque amplía el concepto de manejo sanitario. La salud de los peces no dependería exclusivamente de controlar patógenos o mantener determinados parámetros ambientales, sino también de favorecer condiciones que permitan el desarrollo de comunidades microbianas funcionalmente adecuadas. En este contexto, el microbioma podría transformarse en un nuevo indicador complementario para evaluar el estado fisiológico de los peces. Una posible herramienta de vigilancia sanitaria Uno de los aspectos con mayor potencial aplicado es precisamente el monitoreo del microbioma intestinal. Los cambios en las comunidades bacterianas podrían utilizarse como señales tempranas de alteraciones en la salud de los peces, incluso antes de que aparezcan manifestaciones clínicas evidentes. El concepto abre la posibilidad de desarrollar sistemas de vigilancia capaces de detectar estrés, cambios ambientales o potenciales problemas sanitarios a partir de modificaciones en la composición microbiana. La investigación también aporta una línea base de la microbiota intestinal de salmones silvestres procedentes de distintas áreas geográficas. Esta información podría utilizarse en el futuro para comparar poblaciones y detectar alteraciones asociadas con cambios ambientales. Para la conservación, el valor de esta información va más allá de conocer qué microorganismos habitan en el intestino del salmón. La diversidad microbiana podría constituir un componente adicional de la diversidad biológica de las poblaciones silvestres. Preservar la diversidad microbiana también puede ser una estrategia de conservación Los resultados plantean una dimensión adicional para la protección del salmón silvestre. Las poblaciones naturales están expuestas a dietas variables y a una mayor diversidad de condiciones ambientales que los peces cultivados. Estas características pueden contribuir a mantener comunidades microbianas diferentes y potencialmente más diversas. En un escenario de cambios ambientales, conservar esta diversidad podría adquirir importancia para la capacidad de adaptación de las poblaciones de salmón. Esto significa que la conservación del salmón silvestre no solo implica proteger sus hábitats, mantener sus poblaciones y garantizar sus rutas migratorias. También puede ser relevante preservar las interacciones biológicas que forman parte de su fisiología, entre ellas las comunidades microbianas asociadas al organismo. El próximo desafío: saber qué hacen las bacterias Los investigadores advierten que identificar las bacterias presentes es apenas el primer paso. El gran desafío científico consiste ahora en determinar qué funciones desempeñan dentro del organismo. Entre las principales preguntas se encuentran cómo interactúan estas bacterias con el sistema inmunitario, cómo se relacionan entre sí y de qué manera pueden influir sobre el crecimiento, la salud y la respuesta del pez frente al estrés y las enfermedades. Para responderlas, las próximas investigaciones deberán avanzar desde la caracterización de la composición microbiana hacia el análisis de su función. Es decir, no bastará con saber qué bacterias están presentes, sino que será necesario determinar qué hacen, cómo interactúan y qué consecuencias tienen para el pez. Esta transición desde la descripción hacia la función podría ser determinante para transformar el conocimiento sobre el microbioma en aplicaciones concretas para la acuicultura. Un nuevo componente de la salud del salmón La investigación refuerza una idea que comienza a adquirir relevancia en la ciencia acuícola: el salmón no puede entenderse únicamente como un organismo aislado, sino como un sistema biológico en permanente interacción con comunidades microbianas. Las diferencias encontradas entre salmones silvestres y de cultivo, el efecto de la dieta y los cambios asociados al crecimiento muestran que el microbioma está estrechamente relacionado con las condiciones de vida del pez. Para la industria, el desafío consiste ahora en determinar si es posible utilizar este conocimiento para diseñar estrategias nutricionales, ambientales y sanitarias capaces de favorecer comunidades microbianas asociadas con peces más saludables. Para la conservación, en tanto, el desafío es proteger la diversidad biológica del salmón silvestre incluyendo una dimensión que hasta hace poco permanecía prácticamente invisible: los microorganismos que viven dentro de él. El intestino del salmón podría convertirse así en mucho más que un objeto de estudio. Su microbioma podría transformarse en una nueva ventana para comprender la salud de los peces, anticipar problemas sanitarios y diseñar sistemas de producción más resilientes y sostenibles. Lea el estudio completo aquí: Ecological dynamics of the Atlantic salmon gut microbiota across developmental phases and geographic regions

El intestino del salmón alberga miles de especies de microorganismos que interactúan con el organismo y entre sí. Aunque durante años la atención de la investigación acuícola se ha concentrado principalmente en factores como la genética, la alimentación, las enfermedades y las condiciones ambientales, el microbioma intestinal está adquiriendo una importancia creciente como componente de la salud y la resiliencia de los peces.

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Un equipo de investigadores analizó 847 muestras de contenido intestinal de salmones provenientes de Noruega, Escocia e Irlanda. La investigación incluyó ejemplares silvestres y de cultivo, procedentes tanto de agua dulce como marina. Además del contenido intestinal, los científicos examinaron muestras de alimento y del agua en la que vivían los peces, con el objetivo de determinar qué factores explicaban las diferencias observadas en sus comunidades microbianas.

Una brecha microbiana más amplia de lo esperado

Uno de los principales hallazgos fue la marcada diferencia entre el microbioma intestinal de los salmones silvestres y el de los ejemplares de cultivo. Los salmones de cultivo presentaron una menor diversidad bacteriana y una composición microbiana diferente. De acuerdo con los investigadores, las comunidades bacterianas presentes en estos peces también parecen estar más especializadas y adaptadas a las condiciones propias de los sistemas de cultivo.

Esta diferenciación resulta relevante porque una mayor diversidad microbiana puede proporcionar al organismo una mayor capacidad de respuesta frente a cambios y perturbaciones. En términos ecológicos, una comunidad compuesta por numerosos microorganismos diferentes podría ofrecer una mayor estabilidad funcional ante enfermedades, estrés o modificaciones ambientales.

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Sin embargo, los investigadores advierten que todavía no es posible establecer una relación causal directa entre una menor diversidad bacteriana y una mayor incidencia de enfermedades. El estudio identifica una asociación y plantea una hipótesis que deberá ser investigada mediante nuevos experimentos.

El microbioma cambia a medida que el salmón crece

La investigación también muestra que la comunidad bacteriana intestinal no permanece estática durante el desarrollo del pez. A medida que el salmón crece, determinadas bacterias disminuyen o desaparecen, mientras otras aumentan su abundancia y pasan a dominar la comunidad microbiana. Este fenómeno es consistente con un proceso conocido como sucesión ecológica, mediante el cual las comunidades de microorganismos se modifican progresivamente en respuesta a factores relacionados con el hospedador, la alimentación y el ambiente.

Entre los microorganismos identificados destaca el género Mycoplasma, que aparece en cantidades particularmente elevadas en el intestino del salmón. Los investigadores consideran que este grupo bacteriano ha evolucionado en estrecha asociación con el salmón durante miles de años y se ha convertido en uno de los componentes dominantes de su microbiota intestinal.

La presencia predominante de Mycoplasma, sin embargo, no permite por sí sola determinar si su efecto es beneficioso, perjudicial o simplemente consecuencia de las condiciones fisiológicas del pez. Precisamente, conocer la función de estas bacterias constituye uno de los desafíos centrales para la investigación futura.

La dieta emerge como uno de los factores determinantes

Entre todos los factores analizados, la alimentación aparece como uno de los elementos con mayor capacidad para explicar las diferencias en la microbiota intestinal. El estudio determinó que aproximadamente el 23 % de la variación en la composición bacteriana del salmón de cultivo puede explicarse únicamente por la dieta.

La diferencia resulta especialmente significativa al comparar los sistemas productivos con el ambiente natural. Mientras los salmones de cultivo reciben dietas formuladas y estandarizadas, los ejemplares silvestres consumen una variedad de organismos que cambia según su entorno, etapa de desarrollo y disponibilidad de alimento.

Esta diferencia nutricional puede contribuir a explicar por qué ambos grupos desarrollan comunidades bacterianas tan distintas.

El hallazgo también plantea una cuestión estratégica para la acuicultura: si determinadas características de la dieta favorecen comunidades microbianas asociadas con una mejor condición fisiológica, la formulación del alimento podría convertirse en una herramienta adicional para promover la salud de los peces.

No obstante, aún es necesario determinar qué componentes específicos de la dieta producen estos efectos y, sobre todo, si los cambios en el microbioma se traducen efectivamente en una mayor resistencia frente a enfermedades o estrés.

Más allá de la jaula: el ambiente también importa

La alimentación no es el único factor involucrado. Los investigadores encontraron que el ambiente en el que viven los peces también influye en la composición de sus comunidades bacterianas.

Este efecto varía entre regiones y a través de las distintas etapas del ciclo de vida del salmón. La interacción entre hospedador, alimentación y ambiente genera comunidades microbianas que pueden cambiar considerablemente a lo largo del desarrollo del pez.

Para la industria acuícola, esta perspectiva resulta relevante porque amplía el concepto de manejo sanitario. La salud de los peces no dependería exclusivamente de controlar patógenos o mantener determinados parámetros ambientales, sino también de favorecer condiciones que permitan el desarrollo de comunidades microbianas funcionalmente adecuadas. En este contexto, el microbioma podría transformarse en un nuevo indicador complementario para evaluar el estado fisiológico de los peces.

Una posible herramienta de vigilancia sanitaria

Uno de los aspectos con mayor potencial aplicado es precisamente el monitoreo del microbioma intestinal. Los cambios en las comunidades bacterianas podrían utilizarse como señales tempranas de alteraciones en la salud de los peces, incluso antes de que aparezcan manifestaciones clínicas evidentes. El concepto abre la posibilidad de desarrollar sistemas de vigilancia capaces de detectar estrés, cambios ambientales o potenciales problemas sanitarios a partir de modificaciones en la composición microbiana.

La investigación también aporta una línea base de la microbiota intestinal de salmones silvestres procedentes de distintas áreas geográficas. Esta información podría utilizarse en el futuro para comparar poblaciones y detectar alteraciones asociadas con cambios ambientales.

Para la conservación, el valor de esta información va más allá de conocer qué microorganismos habitan en el intestino del salmón. La diversidad microbiana podría constituir un componente adicional de la diversidad biológica de las poblaciones silvestres.

Preservar la diversidad microbiana también puede ser una estrategia de conservación

Los resultados plantean una dimensión adicional para la protección del salmón silvestre. Las poblaciones naturales están expuestas a dietas variables y a una mayor diversidad de condiciones ambientales que los peces cultivados. Estas características pueden contribuir a mantener comunidades microbianas diferentes y potencialmente más diversas.

En un escenario de cambios ambientales, conservar esta diversidad podría adquirir importancia para la capacidad de adaptación de las poblaciones de salmón.

Esto significa que la conservación del salmón silvestre no solo implica proteger sus hábitats, mantener sus poblaciones y garantizar sus rutas migratorias. También puede ser relevante preservar las interacciones biológicas que forman parte de su fisiología, entre ellas las comunidades microbianas asociadas al organismo.

El próximo desafío: saber qué hacen las bacterias

Los investigadores advierten que identificar las bacterias presentes es apenas el primer paso. El gran desafío científico consiste ahora en determinar qué funciones desempeñan dentro del organismo.

Entre las principales preguntas se encuentran cómo interactúan estas bacterias con el sistema inmunitario, cómo se relacionan entre sí y de qué manera pueden influir sobre el crecimiento, la salud y la respuesta del pez frente al estrés y las enfermedades.

Para responderlas, las próximas investigaciones deberán avanzar desde la caracterización de la composición microbiana hacia el análisis de su función. Es decir, no bastará con saber qué bacterias están presentes, sino que será necesario determinar qué hacen, cómo interactúan y qué consecuencias tienen para el pez.

Esta transición desde la descripción hacia la función podría ser determinante para transformar el conocimiento sobre el microbioma en aplicaciones concretas para la acuicultura.

Un nuevo componente de la salud del salmón

La investigación refuerza una idea que comienza a adquirir relevancia en la ciencia acuícola: el salmón no puede entenderse únicamente como un organismo aislado, sino como un sistema biológico en permanente interacción con comunidades microbianas.

Las diferencias encontradas entre salmones silvestres y de cultivo, el efecto de la dieta y los cambios asociados al crecimiento muestran que el microbioma está estrechamente relacionado con las condiciones de vida del pez.

Para la industria, el desafío consiste ahora en determinar si es posible utilizar este conocimiento para diseñar estrategias nutricionales, ambientales y sanitarias capaces de favorecer comunidades microbianas asociadas con peces más saludables.

Para la conservación, en tanto, el desafío es proteger la diversidad biológica del salmón silvestre incluyendo una dimensión que hasta hace poco permanecía prácticamente invisible: los microorganismos que viven dentro de él.

El intestino del salmón podría convertirse así en mucho más que un objeto de estudio. Su microbioma podría transformarse en una nueva ventana para comprender la salud de los peces, anticipar problemas sanitarios y diseñar sistemas de producción más resilientes y sostenibles.

Lea el estudio completo aquí: Ecological dynamics of the Atlantic salmon gut microbiota across developmental phases and geographic regions

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